娃娃鱼养殖基地的选择应符合企业制定的仿生态繁育基地选择标准，一定要适合娃娃鱼的生活习性：海拔在要求在800～1200米范围，地形地貌较好；大气无污染，周围植被茂盛，有天然的泉眼和山溪，水体无任何污染源，全年水温要在4～25℃，水体透明度和酸碱度应在规定范围之内；年均气温、降雨量、无霜期自然条件等符合要求；交通方便，电力充足。只有这样的条件，才能更利于娃娃鱼养殖，娃娃鱼繁殖，娃娃鱼保护。